用途是一种聚阳离子染料，广泛用于电子显微镜 (EM) 下细胞、组织和营养细菌的观察。能与磷脂和脂肪酸反应强烈，并与酸性粘多糖结合。Ruthenium red 钙离子结合的蛋白相互作用，抑制线粒体Ca2+单向转运体（uniporter）；辣椒辣素拮抗剂；阻断VR1香草素受体偶联离子通道。钌红(36%)还可作为电镜组织Chemicalbook学用着色剂，与戊二醛一同使用进行黏多糖染色，与四氧化锇一同使用增加对比度。在埋封程序期间，其被用于维持病原细菌的腊梅糖。据报导，该产品还用于霍乱孤菌的荚膜着色。
